Najtrudniejszy etap analizy panelu dla dzieci z ZD.
kwiecień 29, 2025 by Jarek
Kategoria: Zespół Downa
Kiedyś jak zaczynałem analizę paneli polimorfizmów nie spodziewałem się tak dużej różnorodności osób z ZD, choć geny i polimorfizmy się zgadzały. Podczas ostatnich analiz dostałem 3 krotnie pytanie: jakie geny w analizie są najtrudniejsze dla osób z ZD?
Zatem odpowiadam. Po pierwsze nie patrzę na geny mocno spersonalizowane jak te dotyczące jelit, czy stanów zapalnych. Po drugie analizuję najważniejsze geny, które mogą istotnie zmienić obraz funkcjonowania metabolizmów w całej populacji. Z tego wyszło mi, że najtrudniejszym układem analizy są geny i to w tej kolejności:
*BHMT
*CBS
*CTH
*AHCY
https://www.zespoldowna.info/analizujemy-metylacje-cz-9-cbssuox-nosbhmt-w-zespole-downa.html
https://www.zespoldowna.info/analiza-metylacji-cz-bhmt-i-cbs.html
Dlaczego jest to tak trudne?
1.Skrót metylacyjny bo o nim tutaj mowa jest krytyczny w ZD, co oznacza że przejmuje istotną role w metylacji. W stosunku do populacji ta ścieżka w ZD stanowi dużo bardziej efektywny układ który jest wykorzystywany w metylacji. To są geny CBS, BHMT.
2.Jeżeli ten istotnie ważny układ jest wyhamowywany przez gen BHMT, który nie jest potrojony, ale jest szczególnie wrażliwy na braki cynku i choliny, a te są systemowe w ZD, to już efekt potrojonego genu CBS daje efekt niejako podwójnego “przekierowania” całego układu. Dodatkowo kluczem do zrozumienia tego jest mało zbadane działanie genu AHCY występującego przed genem CBS oraz genu CTH występującego po nim. Polimorfizmy jakie występują na tych genach mają działanie hamujące (dodatkowo) cały cykl. Zatem pojawia się wiele pytań…i brak odpowiednio precyzyjnych biomarkerów tylko komplikuje analizę.
Dla tego układu charakterystyczna jest bardzo niska homocysteina. O ile bez suplementacji w ZD homocysteina to wartości około 5,5 to z polimorfizmami tych genów to nawet 3,5 μmol/l. Suplementacja jeszcze bardziej to obniża co nie jest ani efektywne, ani właściwe! Zbyt niska homocysteina to także źle!
I zaczynają się problemy. Jeżeli analizujemy amoniak to z perspektywy tego układu powinien być wysoki…a nie jest i to często. Oznacza taki wynik, że wpływ genu CBS nie jest tak istotny, ale pozostałych już tak. Mamy kolejne zatem problemy:
1.Jeżeli weźmiemy pod lupę gen BHMT który powinien dać się podkręcić przy pomocy cynku to nam nie wychodzi to. Dlaczego? W ZD mamy ciągłe braki tego pierwiastka tytułem słabej odporności chociażby, która wykorzystuje go na maksa. Pytanie kiedy jest go na odpowiednim poziomie by obsłużyć wszystkie metabolizmy…tego chyba nikt nie wie.
2.Jeżeli weźmiemy gen CTH to wystarczy wspomnieć, że korek zaczyna się już na genach poniżej, a związanych z metabolizmem witaminy B6. Gen PDXK, potrojony, jest wolny w swoim metabolizmie i powoduje zakłócenie cyklu cysteiny. To daje całościowy obraz szczególnie niepokojący przy polimorfizmach homozygotycznych genu CTH.
3.No i na koniec gen AHCY, który świetnie mimikuje działanie genu CBS. Nigdy nie wiadomo, czy to gen AHCY daje niską homocysteinę, czy tez CBS. Nie ma istotnych narzędzi by poprawić jego działanie, ani biomarkerów by ocenić czy to on jest winny tej sytuacji.
WNIOSEK:
W efekcie wszystko się kumuluje w tym miejscu i nie wiadomo za bardzo od czego zacząć, co jest przyczyną pierwotną. Za każdym razem działa to inaczej, co oznacza że choć wszystko niby się zgadza musimy stale poszukiwać rozwiązań. Stąd kwestia tego elementu jest najtrudniejsza dla mnie w analizie metylacji w ZD.